В фильме «Исчезающий Царьград» речь идёт о трагической судьбе Церкви на территориях, отнятых турками у христианского населения.
В первой части фильма показаны главные христианские святыни Стамбула: храм великомученика Георгия в квартале Фанар (резиденция Константинопольского патриарха), Святая София (мечеть Айя-София), действующий монастырь Живоносного источника, полуразрушенный Студийский монастырь. Помимо стамбула зрители увидят пришедшие в запустение христианские памятники в Никее и Каппадокии.
Во второй части фильма рассказывается о драматической судьбе православия на острове Кипр. Кипрская апостольская церковь одна из самых древних. На острове находится гробница апостола Варнавы, киприота по происхождению. В городе Ларнака хранится саркофаг и честная глава святого Лазаря. Одна из главных святынь Кипра — Киккский монастырь, в котором пребывает чудотворная икона Божией Матери «Милостивая»