Игумен Иннокентий (в миру Сергей Николаевич Павлов) родился в православной семье 15 июля 1952 года в Москве.
В 1977 году был принят во 2-й класс Ленинградской духовной семинарии.
В 1979 году поступил в Ленинградскую духовную академию, которую окончил в 1983 году.
Кандидатская диссертация была посвящена истории РПЦ советского периода.
В марте 1983 года принял монашеский постриг с именем Иннокентий; 5 июня того же года митрополитом Ленинградским и Новгородским Антонием (Мельниковым) был рукоположён в пресвитеры.
В 1983–1987 годах — преподаватель общей церковной истории и истории Русской Церкви в Ленинградской духовной семинарии, а также классный наставник.
В 1987–1993 годы референт по богословским вопросам Отдел внешних церковных сношений (ОВЦС) Московского Патриархата. Принимал участие в разработке документов общецерковного значения, курировал связи Московской Патриархии с Объединенными Библейскими обществами.
С 1991 года член Правления Российского библейского общества.
С 1993 по 1995 год преподавал церковную историю в Общедоступном православном университете, основанном протоиереем Александром Менем.
С 1995 года преподавал в Библейско-богословском институте ап. Андрея.
С 2002 года совершает регулярные богослужения в греко-католической московской общине во имя святителя Филиппа, митрополита Московского.
24 ноября 2003 года был принят в юрисдикцию Истинно-Православной Церкви Рафаила (Мотовилова), архиепископа Московского и митрополита Всероссийского; с осени 2004 года секретарь Священного Синода ИПЦ.
В 2008 году в Истинно-Православной Церкви Рафаила (Мотовилова) получил награду в виде права ношения наперсного креста с украшениями и орден «За веру и верность».
С 1990 года регулярно выступает как публицист в таких изданиях как «Независимая газета», «Сегодня», «Русская мысль», «Церковно-общественный вестник» и «Посев».
С 1995 года вёл три еженедельные программы («Дискуссия на тему», «Литературное обозрение», «Живое слово») на Христианском церковно-общественном канале.
Вел научную работу в области библеистики, церковной истории, историографии и социологии религии; работал над переводом книг Нового Завета на современный русский литературный язык и их комментированием.
