Родился в Волгограде в 1955 году. По окончании Астраханского института рыбной промышленности работал в конструкторском бюро в Севастополе. Здесь пришел к православной вере. В 1983 году по благословению архимандрита Иоанна (Крестьянкина) переехал в Ярославль и поступил пономарем в Феодоровский кафедральный собор, под духовное окормление архимандрита Михея (Хархарова). В том же году принял монашеский постриг и был рукоположен во иеродиакона, а затем во иеромонаха. Спустя четыре года был переведен в новооткрытый Толгский женский монастырь, где в течение 10 лет служил старшим священником, одновременно заведуя рядом хозяйственных подразделений обители.
В 1988 году окончил заочное отделение Московской духовной семинарии. С 1998 года по настоящее время - настоятель Николо-Бабаевского монастыря Ярославской епархии. Творчество. Самый известный труд игумена Бориса (Долженко) «Вначале духовного пути». Книга явилась плодом многолетних наблюдений, чтения и осмысления подвига святых отцов и собственного жизненного опыта ее автора – настоятеля Николо-Бабаевского монастыря Ярославской епархии, в котором провел последние годы жизни святитель Игнатий (Брянчанинов). Отец Борис родился в годы советской власти, обрел веру в сознательном возрасте и прошел путь от мирянина до игумена. Книга будет особо интересна и полезна тем, кто в наше время заново открывает для себя православие, – как живое свидетельство современника, прошедшего тем же путем обретения истины и вхождения в Церковь.
Основные книги и публикации. В начале духовного пути К тихому пристанищу Трудные вопросы духовной жизни
