Родился на Южном Урале в 1956 г. До рукоположения работал помощником машиниста тепловоза, служил в армии, получил режиссерское образование и преподавал, был директором студенческого клуба, экскурсоводом.
В 1982 г. рукоположен в сан диакона, а затем – священника. Член Союза писателей России. Протоиерей Анатолий Трохин является клириком Санкт-Петербургской епархии, служит в храме Спаса Нерукотворного Образа в Парголово.