Иоанн Карпафийский жил в V–VII вв. Его отождествление с карпафийским епископом Иоанном, участником Шестого Вселенского собора, сомнительно; скорее всего, он жил в V в., поскольку его труды в кодексах традиционно помещались рядом с рукописным наследием известных церковных писателей того времени: Диадоха Фотикийского, Нила Синайского и Марка Подвижника.
Писал Иоанн в жанре «глав» – кратких, насыщенных афоризмами изречений на темы богословия, этики и практики монашеской жизни.